站務(wù)板塊經(jīng)過(guò)整合，組建了南京公路客運站務(wù)有限公司，下設南京汽車(chē)客運站、汽車(chē)客運南站、汽車(chē)東站、客運北站、江寧站和葛塘站等6家客運站及南京聯(lián)網(wǎng)售票服務(wù)中心，管理進(jìn)站班線(xiàn)300余條，日發(fā)客流5萬(wàn)人次，高峰日發(fā)18萬(wàn)人次。站務(wù)公司成立后，打破班線(xiàn)資源在各車(chē)站之間的流動(dòng)瓶頸，根據旅客流量、流向合理調配全市班線(xiàn)資源，便捷更多的旅客出行需求。隨著(zhù)高鐵南京北站進(jìn)入十三五計劃，未來(lái)江北客運站也將依高鐵站而建，并規劃建設泰馮路客運站。
南京汽車(chē)客運站（別名：小紅山客運站、南京小紅山站）位于南京市玄武區紅山路1號，比鄰南京火車(chē)站北站房，位于紅山南路以南，南京火車(chē)站站北廣場(chǎng)東邊，屬于鐵路南京火車(chē)站綜合樞紐的重要組成部分。南京汽車(chē)客運站是一級客運站，現有21個(gè)常規售票窗口和10個(gè)臨時(shí)售票窗口；配備18臺自助售票機（其中1臺為現金售票機），24小時(shí)售票；車(chē)站啟用智能自助閘機，網(wǎng)上購票的乘客可以直接刷身份證進(jìn)站乘車(chē)；車(chē)站檢票平臺劃分為上下兩層，共44個(gè)檢票門(mén)號；車(chē)站共有進(jìn)站班車(chē)800多輛，客運班線(xiàn)380多條，正班日發(fā)班次約1100班，車(chē)站日發(fā)送旅客1.5萬(wàn)人次左右，節日高峰可達6萬(wàn)人次，班車(chē)遍及全國19個(gè)省64個(gè)地區。旅客可乘坐南京地鐵1號線(xiàn)、南京地鐵3號線(xiàn)至南京站到達。南京汽車(chē)客運站緊靠南京火車(chē)站，10分鐘之內步行可實(shí)現普鐵、動(dòng)車(chē)、高鐵、長(cháng)途汽車(chē)與公交車(chē)、出租車(chē)、地鐵、機場(chǎng)大巴的無(wú)縫換乘。
南京汽車(chē)客運南站位于南京市雨花臺區玉蘭路98號，是南京南部新城核心區，比鄰亞洲最大高鐵站南京南站，是中國首家實(shí)現火車(chē)、長(cháng)途客運、地鐵、市內公交、出租車(chē)、社會(huì )車(chē)輛等6種運輸方式無(wú)縫鏈接和零距離換乘的新型智能化綜合樞紐汽車(chē)客運站，列為國家重點(diǎn)示范工程。南京汽車(chē)客運南站是一級客運站，設有發(fā)車(chē)位23個(gè)，檢票口21個(gè)，售票窗口22個(gè)，配備直升電梯及多部扶手電梯。營(yíng)運班線(xiàn)156條，輻射范圍覆蓋山東、浙江、湖北、安徽等六省，平均日發(fā)送班車(chē)780個(gè)班次，運送旅客約1.8萬(wàn)人次，節假日最高單日運送旅客量7.5萬(wàn)人次。旅客可乘坐南京地鐵1號線(xiàn)、南京地鐵3號線(xiàn)、南京地鐵S1、S3號線(xiàn)至南京南站到達。南京汽車(chē)客運南站緊靠南京火車(chē)南站，10分鐘之內步行可實(shí)現普鐵、動(dòng)車(chē)、高鐵、長(cháng)途汽車(chē)與公交車(chē)、出租車(chē)、地鐵、機場(chǎng)大巴的無(wú)縫換乘。
南京葛塘汽車(chē)客運站為二級汽車(chē)客運站，位于南京化學(xué)工業(yè)園區寧六路400號，雍莊立交與葛塘立交之間。葛塘站區位優(yōu)越輻射面廣，依托雍莊立交，北通魯冀、南達滬杭、西到皖豫、東至通揚，是省會(huì )城市南京的門(mén)戶(hù)。葛塘站服務(wù)圈輻射范圍包括南京化學(xué)工業(yè)園區、六合區、浦口區。葛塘站占地面積14畝，建筑總面積5736平方米，停車(chē)場(chǎng)地6000平方米，公共基礎設施配套齊全，設計日發(fā)旅客量5000人次。目前隨著(zhù)地鐵S8號線(xiàn)的貫通，葛塘站年發(fā)送旅客已逾60萬(wàn)，并實(shí)現與南京各公路客運站聯(lián)網(wǎng)售票和一線(xiàn)通配載。